开幕-201号道路&真砂镇&双叶镇
再一次从向北走出城镇，沿着201号道路一路向东走到真砂镇，少年就等在研究所门口。少年告诉我们自己名叫明辉（コウキ），是博士的孙子[选择男性主角则这里是博士的孙女小光（ヒカリ）]。突然，劲敌又从里面冲了出来抱怨博士是个怪老头，于是自己向东离开了。进入后进入后博士将之前的宝可梦正式赠予我们，这里可以选择昵称。
拜托我们完成全部的神奥宝可梦图鉴，我们也欣然接受。这之后，我们也正式开始图鉴的收集工作。
出门后明辉会带主角认识各处的设施，包括PC中心，商店等。介绍完毕后，明辉让我们向家人报告一下状况。
再一次回家一趟，妈妈会赠送我们冒险笔记（ぼうけんノート）。
而劲敌的妈妈也急匆匆地跑来说自己的孩子太过冒失，塞给我们一个包裹（おとどけもの）让我们交给劲敌。
自此，我们也告别妈妈和温暖的家，正式开始神奥地区的冒险。临走的时候，妈妈还把帽子交给了我们。
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目录
第1页：开幕-双叶镇
第1页：大地图
第1页：开幕
第1页：双叶镇
第2页：开幕-201号道路&心齐湖
第3页：开幕-201号道路&真砂镇&双叶镇
第4页：到黑金道馆-真砂镇&202号道路
第5页：到黑金道馆-祝庆市
第6页：到黑金道馆-203号道路&黑金闸口
第7页：到黑金道馆-黑金市
第8页：到黑金道馆-黑金道馆
第9页：到百代道馆-祝庆市
第10页：到百代道馆-荒芜小道&204号道路
第11页：到百代道馆-索诺镇
第12页：到百代道馆-205号道路&谷间发电厂
第13页：到百代道馆-索诺花田
第14页：到百代道馆-谷间发电厂
第15页：到百代道馆-205号道路
第16页：到百代道馆-百代森林
第17页：到百代道馆-百代市
第18页：到百代道馆-百代道馆
第19页：到帷幕道馆-百代市
第20页：到帷幕道馆-206&207号道路&天冠山
第21页：到帷幕道馆-208号道路
第22页：到帷幕道馆-绿缘市
第23页：到帷幕道馆-209号道路
第24页：到帷幕道馆-随意镇
第25页：到帷幕道馆-210号道路南侧&215号道路
第26页：到帷幕道馆-帷幕市
第27页：到帷幕道馆-帷幕道馆
第28页：到湿原道馆-帷幕市
第29页：到湿原道馆-214号道路
第30页：到湿原道馆-立志湖畔&213号道路
第31页：到湿原道馆-湿原市
第32页：到湿原道馆-湿原道馆
第33页：到家缘道馆-湿原市
第34页：到家缘道馆-210号道路（北侧）
第35页：到家缘道馆-神和镇
第36页：到家缘道馆-家缘道馆
第37页：到水脉道馆-祝庆市&218号道路
第38页：到水脉道馆-水脉市
第39页：到水脉道馆-钢铁岛
第40页：到水脉道馆-水脉道馆
第41页：到第七道馆
第41页：心齐湖/神事湖
第41页：211号道路&天冠山（北侧）
第41页：216号道路&217号道路&睿智湖畔/英知湖畔
第41页：切峰市/金岬市
第41页：切峰道馆/金岬道馆
第42页：到第八道馆
第42页：帷幕市
第42页：天冠山（南侧）
第42页：枪之柱
第42页：222号道路
第42页：滨海市/名木市
第42页：滨海道馆/名木道馆
第43页：到冠军之路
第43页：冠军之路
第44页：到一周目通关
第44页：虫系天王 阿柳
第44页：地面系天王 菊野
第44页：火系天王 大叶/奥巴
第44页：超能系天王 悟松/五洋
第44页：冠军 竹兰/白菜/希罗娜
